Zwei Jahre sind vergangen, seit Mäuserich Stuart ein wohliges Heim bei der inzwischen um ein kleines Töchterchen vergrößerten Familie Little fand, und selbst Hauskatze Snowbell hat längst Frieden mit dem freundlichen Nagezahn geschlossen. Probleme tauchen auf, als Stuart sich in die kleine Vogeldame Margalo verliebt, die ihrerseits von einem bösen Falken drangsaliert wird. Stuart, immer der Gentleman, würde ihr Problem gern eigenhändig lösen, doch nicht nur Snowbell befürchtet, das Margalo ein falsches Spiel treibt.
Auch Geena Davis und Kinderstar Jonathan Lipnicki ("Jerry Maguire") sind wieder mit von der Partie, wenn Stuart Little zum zweiten abendfüllenden Kino-Abenteuer bittet.
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